Timothee TTimo Besset, de id Software confirmó que Quake 4 tendrá una versión nativa para GNU/Linux. El servidor dedicado saldrá al mismo tiempo que la versión para Windows, mientras que el cliente para GNU/Linux se retrasará una o dos semanas. Quake 4 es el primer juego en utilizar la revolucionaria tecnología de Doom III y tentativamente estaría listo este mismo mes.

Quake 4 para GNU/Linux utilizará el Simple Direct Media Layer (SDL) para las entradas y el OpenGL.